La simulación de las organizaciones internacionales empezó incluso antes de la creación de las Naciones Unidas, cuando estudiantes celebraron un Modelo de la Sociedad de las Naciones en los años 20. El programa del Modelo de Naciones Unidas es el sucesor de una simulación a cargo de estudiantes que precedió a la propia ONU, pero no hay datos concretos acerca de cómo comenzó exactamente el Modelo de Naciones Unidas.

En el presente, el PMNU ha sido implementado en mas de 6,000 escuelas y en 3,200 universidades alrededor del mundo, y se coordinan cerca de 400 conferencias de MNU en 35 países anualmente. En Puerto Rico, por más de una década, la Universidad de Puerto Rico (RUM), integra el Modelo de la ONU como un curso del Departamento de Ciencias Sociales. Además, alrededor de 25 escuelas privadas han coordinado dos organizaciones estudiantiles dedicadas al desarrollo de clubes, mientras coordinan y participan en conferencias de MNU a nivel local e internacional; el Congreso Puertorriqueño y la Federación de las Naciones Unidas.